- Agromyza abiens
- Agromyza albipennis
- Agromyza albitarsis
- Agromyza alnibetulae
- Agromyza alnivora
- Agromyza alunulata
- Agromyza ambigua
- Agromyza anthracina
- Agromyza apfelbecki
- Agromyza baetica
- Agromyza bicophaga
- Agromyza bromi
- Agromyza brunnicosa
- Agromyza cinerascens
- Agromyza demeijerei
- Agromyza dipsaci
- Agromyza drepanura
- Agromyza erodii
- Agromyza erythrocephala
- Agromyza felleri
- Agromyza ferruginosa
- Agromyza filipendulae
- Agromyza flaviceps
- Agromyza flavipennis
- Agromyza frontella
- Agromyza graminicola
- Agromyza hendeli
- Agromyza heraclei
- Agromyza hiemalis
- Agromyza idaeiana
- Agromyza idaeiana puparium
- Agromyza igniceps
- Agromyza intermittens
- Agromyza johannae
- Agromyza kiefferi
- Agromyza lathyri
- Agromyza lithospermi
- Agromyza lucida
- Agromyza luteifrons
- Agromyza luteitarsis
- Agromyza marionae
- Agromyza megalopsis
- Agromyza mobilis
- Agromyza myosotidis
- Agromyza nana
- Agromyza nigrella
- Agromyza nigrescens
- Agromyza nigripes
- Agromyza nigrociliata
- Agromyza orobi
- Agromyza oryzae
- Agromyza phragmitidis
- Agromyza pittodes
- Agromyza polygoni
- Agromyza prespana
- Agromyza pseudoreptans
- Agromyza pseudorufipes
- Agromyza pulla
- Agromyza reptans
- Agromyza rondensis
- Agromyza rozkosnyi
- Agromyza rufipes
- Agromyza salicina
- Agromyza spenceri
- Agromyza spiraeoidearum
- Agromyza sulfuriceps
- Agromyza trebinjensis
- Agromyza varicornis
- Agromyza viciae
- Agromyza vicifoliae
- Agromyza woerzi