- Ascomycota
- Saccharomycotina
- Taphrinomycotina
- Ascomycota incertae sedis
- Acrodontiella
- Apiocarpella
- Briosia
- Chaetopyrena
- Cheilaria
- Cryptomycella
- Cryptomycina
- Cryptosporium
- Discogloeum
- Ectostroma
- Endoconospora
- Exosporium
- Fusamen
- Fusoma
- Graphiothecium
- Gyoerffyella
- Haplobasidion
- Hymenula
- Micropera
- Miricatena
- Monodidymaria
- Myriellina
- Myxosporium
- Neoramularia
- Perisporium
- Pestalozziella
- Pestalozzina
- Phyllohendersonia
- Pseudodiplodia
- Pseudoseptoria
- Radulidium
- Ramulaspera
- Ruggieria
- Schroeteria
- Septogloeum
- Spermospora
- Sphaeronaema
- Stigmatea
- Stigmella
- Thoracella
- Titaeospora
- Tretovularia
- Trichoseptoria
- Utrechtiana roumeguerei
- Veronidia
- Wettsteinina
- Pezizomycotina
- Basidiomycota
- Entorrhizomycota