- Mycosphaerellaceae
- Asperisporium
- Caryophylloseptoria
- Cercospora
- Cercospora acanthi
- Cercospora achilleae
- Cercospora adusta
- Cercospora althaeina
- Cercospora amaryllidis
- Cercospora angulata
- Cercospora apii
- Cercospora apiicola
- Cercospora aragonensis
- Cercospora ari
- Cercospora ariminensis
- Cercospora armoraciae
- Cercospora asparagi
- Cercospora asplenii
- Cercospora astragali
- Cercospora barbareae
- Cercospora begoniae
- Cercospora berteroae
- Cercospora beticola
- Cercospora bicolor
- Cercospora bidentis
- Cercospora bizzozeriana
- Cercospora brachiata
- Cercospora calendulae
- Cercospora callae
- Cercospora capparidis
- Cercospora cardamines
- Cercospora caricis
- Cercospora carthami
- Cercospora cassiocarpa
- Cercospora centaureae
- Cercospora cephalantherae
- Cercospora cheiranthi
- Cercospora chenopodii
- Cercospora chondrillae
- Cercospora cichorii
- Cercospora cistinearum
- Cercospora coryli
- Cercospora crepidis
- Cercospora cyperi-fusci
- Cercospora davisii
- Cercospora decolor
- Cercospora depazeoides
- Cercospora echii
- Cercospora elaterii
- Cercospora elongata
- Cercospora epipactidis
- Cercospora erysimi
- Cercospora euphorbiae-pubescentis
- Cercospora euphrasiae
- Cercospora fagopyri
- Cercospora ficariae
- Cercospora fragariae
- Cercospora galegae
- Cercospora glycyrrhizae-echinatae
- Cercospora grandissima
- Cercospora helianthicola
- Cercospora heliotropii-bocconii
- Cercospora hippocrepidis
- Cercospora imperatoriae
- Cercospora innumerabilis
- Cercospora insulana
- Cercospora ipomoeae
- Cercospora isopyri
- Cercospora juncina
- Cercospora kabatiana
- Cercospora kikuchii
- Cercospora lactucae-sativae
- Cercospora lathyri
- Cercospora lathyrina
- Cercospora ligustri
- Cercospora loti
- Cercospora lycii
- Cercospora maianthemi
- Cercospora malvarum
- Cercospora malvicola
- Cercospora marrubii
- Cercospora medicaginis
- Cercospora mercurialis
- Cercospora mirabilis
- Cercospora montenegrina
- Cercospora montiae
- Cercospora moravica
- Cercospora moricola
- Cercospora nasturtii
- Cercospora nebulosa
- Cercospora nigellae
- Cercospora ocellata
- Cercospora olivascens
- Cercospora onobrychidis
- Cercospora palustris
- Cercospora pantoleuca
- Cercospora paridis
- Cercospora penzigii
- Cercospora physalidis
- Cercospora physospermi
- Cercospora plantaginis
- Cercospora plumbaginea
- Cercospora psoraleae-bituminosae
- Cercospora punctiformis
- Cercospora radiata
- Cercospora rautensis
- Cercospora resedae
- Cercospora rhagadioli
- Cercospora ribis
- Cercospora richardiicola
- Cercospora ricinella
- Cercospora sagittariae
- Cercospora salviicola
- Cercospora sancti-marini
- Cercospora scandens
- Cercospora scorodoniae
- Cercospora scorzonerae
- Cercospora scrophulariae
- Cercospora selaginellarum
- Cercospora senecionis
- Cercospora setariae
- Cercospora solani
- Cercospora sorghi
- Cercospora statices
- Cercospora tau-saghysiana
- Cercospora taurica
- Cercospora tetragoniae
- Cercospora tragopogonis
- Cercospora traversoana
- Cercospora tripolitana
- Cercospora verbascicola
- Cercospora viburnicola
- Cercospora violae
- Cercospora zebrina
- Cercospora zinniae
- Cercospora zonata
- Cercospora zygophylli
- Cercosporella
- Cercosporella coronillae
- Cercosporella echinulata
- Cercosporella equiseti
- Cercosporella euonymi
- Cercosporella leuzeae
- Cercosporella lindaviana
- Cercosporella lini
- Cercosporella myosotidis
- Cercosporella oxalidis
- Cercosporella podospermi
- Cercosporella primulae
- Cercosporella ptarmicae
- Cercosporella sennenii
- Cercosporella virgaureae
- Chuppomyces
- Davidiella
- Didymaria
- Dothistroma
- Exutisphaerella
- Filiella
- Fulvia
- Fusicladiella
- Fusoidiella
- Graminopassalora
- Isariopsis
- Lecanosticta
- Mycosphaerella
- Mycosphaerella aceris
- Mycosphaerella alchemillicola
- Mycosphaerella althaeina
- Mycosphaerella anthemidina
- Mycosphaerella anthurii
- Mycosphaerella arbuticola
- Mycosphaerella asperulata
- Mycosphaerella aucubae
- Mycosphaerella aurantiorum
- Mycosphaerella brunneola
- Mycosphaerella bubakii
- Mycosphaerella castaneicola
- Mycosphaerella chamaeropis
- Mycosphaerella clymenia
- Mycosphaerella crataegi
- Mycosphaerella dalmatica
- Mycosphaerella dianthi
- Mycosphaerella equiseti
- Mycosphaerella equiseticola
- Mycosphaerella filicum
- Mycosphaerella hedericola
- Mycosphaerella hesperidum
- Mycosphaerella huteriana
- Mycosphaerella hypostomatica
- Mycosphaerella isariphora
- Mycosphaerella juniperina
- Mycosphaerella lindingeri
- Mycosphaerella mediterranea
- Mycosphaerella octopetalae
- Mycosphaerella omphalosporoides
- Mycosphaerella oxyacanthae
- Mycosphaerella pinifolia
- Mycosphaerella pomi
- Mycosphaerella pruni-persicae
- Mycosphaerella pyri
- Mycosphaerella pyrolae
- Mycosphaerella rubefaciens
- Mycosphaerella salicicola
- Mycosphaerella schelkovnikovii
- Mycosphaerella silenis
- Mycosphaerella stemmatea
- Mycosphaerella superflua
- Mycosphaerella tingens
- Mycosphaerella vulnerariae
- Mycosphaerella zeae
- Neocercospora
- Neocercosporidium
- Neoovularia
- Neopassalora
- Neophloeospora
- Neopseudocercosporella
- Nothopseudocercospora
- Ovularia
- Paracercosporidium
- Passalora
- Passalora acericola
- Passalora actaeae
- Passalora alni
- Passalora angelicae
- Passalora arachidicola
- Passalora ariae
- Passalora avicularis
- Passalora bacilligera
- Passalora bellynckii
- Passalora bolleana
- Passalora bupleuri
- Passalora calystegiae
- Passalora campi-silii
- Passalora carlinae
- Passalora circumscissa
- Passalora cnidii
- Passalora comari
- Passalora concors
- Passalora dioscoreae
- Passalora dissiliens
- Passalora dulcamarae
- Passalora effusa
- Passalora fraxini
- Passalora galii
- Passalora heterospora
- Passalora hyperici
- Passalora jacquiniana
- Passalora lobeliae-cardinalis
- Passalora maculicola
- Passalora malkoffii
- Passalora marmorata
- Passalora microsperma
- Passalora milii
- Passalora minutissima
- Passalora murina
- Passalora pastinacae
- Passalora periclymeni
- Passalora pilophila
- Passalora polygonati
- Passalora pteridis
- Passalora puncta
- Passalora quercus
- Passalora ramularioides
- Passalora rhamni
- Passalora ribis-rubri
- Passalora rosae
- Passalora rubrotincta
- Passalora scandicearum
- Passalora scariolae
- Passalora squalidula
- Passalora thalictri
- Passalora thalictrina
- Passalora vexans
- Phacellium
- Phaeoramularia
- Phloeospora
- Polythrincium
- Pseudocercospora
- Pseudocercospora acericola
- Pseudocercospora adonidis
- Pseudocercospora asphodelina
- Pseudocercospora bacilligera
- Pseudocercospora bonjeaniae
- Pseudocercospora cavarae
- Pseudocercospora ceratoniae
- Pseudocercospora cladosporioides
- Pseudocercospora concentrica
- Pseudocercospora crataegi
- Pseudocercospora cruenta
- Pseudocercospora exosporioides
- Pseudocercospora geicola
- Pseudocercospora geraniicola
- Pseudocercospora griseola
- Pseudocercospora kaki
- Pseudocercospora laxipes
- Pseudocercospora lilacis
- Pseudocercospora lycopodis
- Pseudocercospora molleriana
- Pseudocercospora myrticola
- Pseudocercospora neriella
- Pseudocercospora nodosa
- Pseudocercospora nymphaeacea
- Pseudocercospora opuli
- Pseudocercospora pistacina
- Pseudocercospora platanigena
- Pseudocercospora populigena
- Pseudocercospora portilloi
- Pseudocercospora puderi
- Pseudocercospora pulvinulata
- Pseudocercospora ramischiae
- Pseudocercospora rhoina
- Pseudocercospora rubi
- Pseudocercospora sabbatiae
- Pseudocercospora saniculae-europaeae
- Pseudocercospora unicolor
- Pseudocercospora veronicicola
- Pseudocercospora viburnigena
- Pseudocercospora vitis
- Pseudocercosporella
- Pseudocercosporella achilleae-millefolii
- Pseudocercosporella aconiti
- Pseudocercosporella alliicola
- Pseudocercosporella angustana
- Pseudocercosporella aronicicola
- Pseudocercosporella aspidii
- Pseudocercosporella astragali
- Pseudocercosporella cytisi
- Pseudocercosporella eleonorae-reginae
- Pseudocercosporella eryngii
- Pseudocercosporella filicis-feminae
- Pseudocercosporella gei
- Pseudocercosporella harcynica
- Pseudocercosporella hieracii
- Pseudocercosporella inconspicua
- Pseudocercosporella junci
- Pseudocercosporella lappulae
- Pseudocercosporella magnusiana
- Pseudocercosporella narcissi
- Pseudocercosporella nicolai
- Pseudocercosporella oxyriae
- Pseudocercosporella saxifragae
- Pseudocercosporella scirpi
- Pseudocercosporella septorioides
- Pseudocercosporella smyrnii
- Pseudocercosporella sublineolata
- Pseudocercosporella tatrensis
- Pseudocercosporella thalictri
- Pseudocercosporella tragopogonis
- Pseudocercosporella trollii
- Pseudocercosporella woronowii
- Ragnhildiana
- Ramularia
- Ramularia abscondita
- Ramularia achilleae-millefolii
- Ramularia acris
- Ramularia acroptili
- Ramularia adoxae
- Ramularia agrestis
- Ramularia agrestis var. deflectens
- Ramularia agrimoniae
- Ramularia ajugae
- Ramularia alaterni
- Ramularia alnicola
- Ramularia alnicola var. multiseptata
- Ramularia alpina
- Ramularia anagallidis
- Ramularia anchusae
- Ramularia angustissima
- Ramularia anthemidis
- Ramularia aplospora
- Ramularia archangelicae
- Ramularia aremoniae
- Ramularia armoraciae
- Ramularia arnicalis-montanae
- Ramularia aromatica
- Ramularia asplenii
- Ramularia asteris
- Ramularia atropae
- Ramularia australis
- Ramularia bartsiae
- Ramularia beccabungae
- Ramularia bellidis
- Ramularia bellunensis
- Ramularia beticola
- Ramularia biflorae
- Ramularia biscutellae
- Ramularia bistortae
- Ramularia bornmuelleriana
- Ramularia bosniaca
- Ramularia botrychii
- Ramularia bresadolae
- Ramularia brunellae
- Ramularia brunnea
- Ramularia brunneopunctata
- Ramularia bryoniae
- Ramularia bulgarica
- Ramularia buniadis
- Ramularia buphthalmi
- Ramularia caduca
- Ramularia calaminthae
- Ramularia calcea
- Ramularia callistephi
- Ramularia calthae
- Ramularia campanulae-barbatae
- Ramularia campanulae-latifoliae
- Ramularia cardamines
- Ramularia cardui
- Ramularia cardui-personatae
- Ramularia carneola
- Ramularia celastri
- Ramularia centaureae-atropurpureae
- Ramularia centaureae-jaceae
- Ramularia cercosporelloides
- Ramularia cerinthes
- Ramularia chaerophylli
- Ramularia chalcedonica
- Ramularia chamaedryos
- Ramularia chamaenerii
- Ramularia chamaepeucis
- Ramularia chelidonii
- Ramularia coccinea
- Ramularia coleosporii
- Ramularia collo-cygni
- Ramularia concomitans
- Ramularia cortusae
- Ramularia corydalina
- Ramularia coryli
- Ramularia crassiuscula
- Ramularia crepidis
- Ramularia crupinae
- Ramularia cupulariae
- Ramularia curvula
- Ramularia cylindroides
- Ramularia cylindroides var. angustispora
- Ramularia cynarae
- Ramularia cynoglossi
- Ramularia daniloi
- Ramularia deusta
- Ramularia deusta var. alba
- Ramularia dianthi
- Ramularia didyma
- Ramularia didyma var. exigua
- Ramularia didymarioides
- Ramularia digitalis
- Ramularia doronici
- Ramularia echii
- Ramularia endophylla
- Ramularia epilobiana
- Ramularia episphaeria
- Ramularia evanida
- Ramularia fagopyri
- Ramularia filaris
- Ramularia filiformis
- Ramularia galegae
- Ramularia galeopsidis
- Ramularia galii
- Ramularia gardeniae
- Ramularia gei
- Ramularia geranii
- Ramularia geranii var. erodii
- Ramularia glechomatis
- Ramularia gracilispora
- Ramularia gratiolae
- Ramularia grevilleana
- Ramularia hellebori
- Ramularia heraclei
- Ramularia hyperici
- Ramularia hypericicola
- Ramularia inaequalis
- Ramularia interstitialis
- Ramularia islandica
- Ramularia jaapiana
- Ramularia jaczevskii
- Ramularia jordanovii
- Ramularia jubatskana
- Ramularia keithii
- Ramularia lactea
- Ramularia lactucosa
- Ramularia lamii
- Ramularia lamii var. minor
- Ramularia lapponica
- Ramularia lapsanae
- Ramularia lata
- Ramularia libanotidis
- Ramularia ligustrina
- Ramularia liliicola
- Ramularia linariae
- Ramularia lithospermi
- Ramularia lonicerae
- Ramularia lychndicola
- Ramularia lysimachiae
- Ramularia macrospora
- Ramularia macularis
- Ramularia major
- Ramularia marrubii
- Ramularia matricariae
- Ramularia medicaginis
- Ramularia melampyri
- Ramularia menthicola
- Ramularia mercurialis-perennis
- Ramularia microspora
- Ramularia mimuli
- Ramularia moehringiae
- Ramularia mulgedii
- Ramularia nagornyi
- Ramularia obducens
- Ramularia oenotherae-biennis
- Ramularia onobrychidis
- Ramularia oreophila
- Ramularia origanicola
- Ramularia parietariae
- Ramularia periplocae
- Ramularia petuniae
- Ramularia peucedani
- Ramularia philadelphi
- Ramularia phlomidicola
- Ramularia phlomidis
- Ramularia pimpinellae
- Ramularia pivensis
- Ramularia plantaginis
- Ramularia polygalae
- Ramularia pratensis
- Ramularia prenanthis
- Ramularia primulae
- Ramularia pseudomaculiformis
- Ramularia pulsatillae
- Ramularia purpurascens
- Ramularia pusilla
- Ramularia ragnhildianicola
- Ramularia ranunculi-montani
- Ramularia ranunculicola
- Ramularia rapunculoides
- Ramularia rhabdospora
- Ramularia rhaetica
- Ramularia rigidula
- Ramularia robiciana
- Ramularia rollandii
- Ramularia rosea
- Ramularia rubella
- Ramularia rufibasis
- Ramularia rufomaculans
- Ramularia rumicis
- Ramularia rumicis-scutati
- Ramularia sabaudica
- Ramularia salviae-pratensis
- Ramularia sambucina
- Ramularia saxifragae
- Ramularia saximontanensis
- Ramularia schulzeri
- Ramularia scolopendrii
- Ramularia scopoliae
- Ramularia septata
- Ramularia serratulina
- Ramularia silenes-procumbentis
- Ramularia silenicola
- Ramularia silvestris
- Ramularia simplex
- Ramularia sparganii
- Ramularia sphaeroidea
- Ramularia spiraeae
- Ramularia stolonifera
- Ramularia succisae
- Ramularia tanaceti
- Ramularia tecta
- Ramularia telekiae
- Ramularia theicola
- Ramularia tiliae
- Ramularia torrendii
- Ramularia triboutiana
- Ramularia tricherae
- Ramularia trifolii
- Ramularia trollii
- Ramularia ufensis
- Ramularia ulmariae
- Ramularia ulmariae var. spiraeae-arunci
- Ramularia unterseheri
- Ramularia uredinearum
- Ramularia uredinicola
- Ramularia uredinis
- Ramularia urticae
- Ramularia valerianae
- Ramularia valerianae var. centranthi
- Ramularia vallisumbrosae
- Ramularia veronicae
- Ramularia veronicicola
- Ramularia vincae
- Ramularia vincae var. vincae-mediae
- Ramularia vincetoxici
- Ramularia vitis
- Ramularia vossiana
- Ramularia weigelicola
- Ramularia winteri
- Ramularia xanthii
- Ramulariopsis
- Rhabdospora
- Rosisphaerella
- Ruptoseptoria
- Scolecostigmina
- Septocylindrium
- Septoria
- Septoria abutilonis
- Septoria acaciae
- Septoria acanthi
- Septoria acanthina
- Septoria acerella
- Septoria acerina
- Septoria acetosae
- Septoria achilleicola
- Septoria achyranthis
- Septoria aciculosa
- Septoria adenophorae
- Septoria aderholdii
- Septoria adonidis
- Septoria aegopodii
- Septoria aegopodina
- Septoria aetheorrhizae
- Septoria aethusae
- Septoria affinis
- Septoria agrimoniae-eupatoriae
- Septoria agrimoniicola
- Septoria ajugae
- Septoria alchemillae
- Septoria alliariae
- Septoria alliorum
- Septoria alni
- Septoria alnigena
- Septoria alopecuri-agrestis
- Septoria alpicola
- Septoria alyssi
- Septoria ambigua
- Septoria amicabilis
- Septoria ammophilae
- Septoria ampelina
- Septoria anarrhina
- Septoria anaxaea
- Septoria anaxeoides
- Septoria anchusae
- Septoria anemones
- Septoria anthrisci
- Septoria anthyllidicola
- Septoria anthyllidis
- Septoria antirrhini
- Septoria apiicola
- Septoria aquilegiae
- Septoria aquilina
- Septoria arbuti
- Septoria arbutina
- Septoria arcautei
- Septoria arethusa
- Septoria aristolochiae var. maculicola
- Septoria armeriae
- Septoria armoraciae
- Septoria arnicae
- Septoria arnoseridis
- Septoria aromatica
- Septoria arrhenatheri
- Septoria artemisiae
- Septoria artemisiae-maritimae
- Septoria arunci
- Septoria asaricola
- Septoria asclepiadea
- Septoria ascochytella
- Septoria ascochytoides
- Septoria asperulae-taurinae
- Septoria asplenii
- Septoria associata
- Septoria astericola
- Septoria asterina
- Septoria asterinum
- Septoria astragali
- Septoria aucubae
- Septoria azaleae
- Septoria balloticola
- Septoria balsaminae
- Septoria baudysiana
- Septoria bellidicola
- Septoria berteroae
- Septoria besseyi
- Septoria betulae-odoratae
- Septoria betulina
- Septoria bidentis
- Septoria bolivari
- Septoria brachypodiicola
- Septoria brachypodina
- Septoria brachyspora
- Septoria bractearum
- Septoria bresadoleana
- Septoria brizae
- Septoria brunellae
- Septoria buniadis
- Septoria buphthalmi
- Septoria bupleuricola
- Septoria caerulescens
- Septoria cajadensis
- Septoria calamagrostidis
- Septoria calaminthae
- Septoria calendulae
- Septoria callae
- Septoria callistephi
- Septoria calystegiae
- Septoria camelinae
- Septoria campanulae
- Septoria cannabina
- Septoria cannabis
- Septoria capparidis
- Septoria caraganae
- Septoria cardamines
- Septoria cardamines-resedifoliae
- Septoria cardunculi
- Septoria caricinella
- Septoria caricis
- Septoria caricis-montanae
- Septoria carisolensis
- Septoria carlinae
- Septoria carotae
- Septoria carrubi
- Septoria carthamicola
- Septoria carthusianorum
- Septoria carvi
- Septoria catariae
- Septoria cathartica
- Septoria celtidis
- Septoria centaureae
- Septoria centaureicola
- Septoria centranthicola
- Septoria centrophylli
- Septoria cephalariae-alpinae
- Septoria cerastii
- Septoria chaenorrhini
- Septoria chaerophylli
- Septoria chaerophylli-aromatici
- Septoria chamaecysti
- Septoria chanousiana
- Septoria cheiranthi
- Septoria cheiriana
- Septoria chelidonii
- Septoria chrysanthemella
- Septoria chrysanthemi-rotundifolii
- Septoria cichori
- Septoria cichori 2
- Septoria cirrosae
- Septoria cirsii
- Septoria cirsii-heterophylli
- Septoria cisti
- Septoria citrullicola
- Septoria clematidis
- Septoria clematidis-flammulae
- Septoria clematidis-rectae
- Septoria colchici
- Septoria colchici 2
- Septoria coleostephi
- Septoria collinae
- Septoria commutata
- Septoria conii
- Septoria convolvuli
- Septoria convolvuli var. convolvuli-persici
- Septoria convolvuli var. soldanellae
- Septoria coriariae
- Septoria cornina
- Septoria corollae
- Septoria crataegi
- Septoria crataegicola
- Septoria crataegophila
- Septoria crepidis
- Septoria crepidis-virentis
- Septoria cruciatae
- Septoria cucubali
- Septoria cucumis
- Septoria cucurbitacearum
- Septoria cucurbitae
- Septoria cupheae
- Septoria cyani
- Septoria cyclaminis
- Septoria cydoniae
- Septoria cydonicola
- Septoria cymbalariae
- Septoria cymbalarina
- Septoria cytisi
- Septoria cytisi-hirsuti
- Septoria cytisina
- Septoria czarnohorica
- Septoria dacica
- Septoria dalmatica
- Septoria daucina
- Septoria delphinella
- Septoria delphinii
- Septoria dianthicola
- Septoria didyma
- Septoria didyma f. santonensis
- Septoria diedickeana
- Septoria diedickei
- Septoria digitalicola
- Septoria digitalis
- Septoria dimera
- Septoria diplotaxis
- Septoria dipsaci
- Septoria distachya
- Septoria doronici
- Septoria dryophila
- Septoria dulcamarae
- Septoria dysentericae
- Septoria ebuli
- Septoria echinopis
- Septoria elaeospora
- Septoria elymi
- Septoria elymi-europaei
- Septoria emeri
- Septoria endiviae
- Septoria epilobii
- Septoria epipactidis
- Septoria erigerontis
- Septoria eriobotryae
- Septoria erythronii
- Septoria escalloniae
- Septoria euonymi
- Septoria eupatorii
- Septoria euphorbiae
- Septoria euphorbiae-nicaeaensis
- Septoria expansa
- Septoria fairmanii
- Septoria festucae
- Septoria ficariae
- Septoria flammulae
- Septoria fragariaecola
- Septoria frangulae
- Septoria fuchsiae
- Septoria fuchsiicola
- Septoria fulvescens
- Septoria fusispora
- Septoria galegae-orientalis
- Septoria galeobdoli
- Septoria galeopsidis
- Septoria galinsogae
- Septoria gardeniae
- Septoria gentianicola
- Septoria geranii
- Septoria gerberae
- Septoria gladioli
- Septoria gleditschiae
- Septoria globosa
- Septoria globulariae
- Septoria glomerata
- Septoria glycines
- Septoria gomphocarpi
- Septoria gratiolae
- Septoria grylli
- Septoria guepini
- Septoria gymnadeniae
- Septoria gypsophilae
- Septoria hariotiana
- Septoria hedericola
- Septoria helenii
- Septoria helianthi
- Septoria helianthina
- Septoria henningsiana
- Septoria henriquesii
- Septoria henryana
- Septoria heraclei
- Septoria heracleicola
- Septoria heterochroa
- Septoria hibisci
- Septoria hispanica
- Septoria hotejae
- Septoria hoyae
- Septoria hydrangeae
- Septoria hydrocotyles
- Septoria hymenocarpi
- Septoria hyoscyami
- Septoria hypochaeridis
- Septoria hypochoeridis
- Septoria iberidis
- Septoria ignatiana
- Septoria ilicifolia
- Septoria incondita
- Septoria inconspicua
- Septoria inulae
- Septoria iridis
- Septoria iridis-japonicae
- Septoria isatidis
- Septoria ischaemi
- Septoria jasiones
- Septoria jasionicola
- Septoria jasmini
- Septoria jussiaeacea
- Septoria kaznowskii
- Septoria kozo-poljanskii
- Septoria laburni
- Septoria lachastreana
- Septoria lactucae
- Septoria lactucina
- Septoria lallemantiae
- Septoria lamiicola
- Septoria lapadensis
- Septoria lapparum
- Septoria lapsanae
- Septoria laubertiana
- Septoria lavandulae
- Septoria leguminum
- Septoria leontodontis
- Septoria lepidii
- Septoria leucanthemi
- Septoria levistici
- Septoria leycesteriae
- Septoria libanotidis
- Septoria ligustri
- Septoria limonum
- Septoria linicola
- Septoria linnaeae
- Septoria linosyris
- Septoria littorea
- Septoria lobeliae
- Septoria lobeliae-syphiliticae
- Septoria longispora
- Septoria lonicerae
- Septoria losae
- Septoria loti
- Septoria luzulae
- Septoria lycii
- Septoria lycoctoni
- Septoria lycopersici
- Septoria lycopi
- Septoria lysimachiae
- Septoria lythrina
- Septoria maclurae
- Septoria macrophomospora
- Septoria macropoda
- Septoria magnusiana
- Septoria mahoniae
- Septoria maianthermi
- Septoria maireana
- Septoria majalis
- septoria malisorica
- Septoria marmorata
- Septoria martianoffiana
- Septoria massalongiana
- Septoria matricariae
- Septoria melampyri
- Septoria meliae
- Septoria melianthi
- Septoria melicae
- Septoria melissae
- Septoria mellittidis
- Septoria melongenae
- Septoria menthae
- Septoria menyanthis
- Septoria menziesiae
- Septoria mercurialis
- Septoria mespili
- Septoria microlonchi
- Septoria microsora
- Septoria mimuli
- Septoria moesiaca
- Septoria monspessulani
- Septoria moschatae
- Septoria mougeotii
- Septoria mulgedii
- Septoria murina
- Septoria muscari
- Septoria myosotidis
- Septoria myricae
- Septoria myriotheca
- Septoria nannizzii
- Septoria napelli
- Septoria narcissi
- Septoria negundinicola
- Septoria negundinis
- Septoria noli-tangere
- Septoria nupharis
- Septoria obesa
- Septoria obscura
- Septoria obscurata
- Septoria odontitis
- Septoria oenanthes
- Septoria oenotherae
- Septoria oleae
- Septoria oleaginea
- Septoria oleandricola
- Septoria oleandrina
- Septoria oligocarpa
- Septoria onobrychidis
- Septoria onopordonis
- Septoria orchidearum
- Septoria orchidearum var. listerae
- Septoria oreophila
- Septoria origanicola
- Septoria origanicola var. majoranae
- Septoria orni
- Septoria ornithogali
- Septoria ornithogalicola
- Septoria osmanthi
- Septoria oxalidis
- Septoria oxytropeos
- Septoria paeoniae
- Septoria parasitica
- Septoria paridis
- Septoria parnassiae
- Septoria pastinacae
- Septoria paulowniae
- Septoria pentandrina
- Septoria penzigii
- Septoria periplocae
- Septoria petroselini
- Septoria phalaridis
- Septoria phaseoli
- Septoria phillyreae
- Septoria phleina
- Septoria phlogis
- Septoria phlomidis
- Septoria phlomidis-herbae-venti
- Septoria phragmitis
- Septoria phyllachoroides
- Septoria phyllostichoides
- Septoria phyteumatis
- Septoria phyteumatum
- Septoria phytolaccae
- Septoria pinzolensis
- Septoria pisi
- Septoria pistaciae
- Septoria pistaciarum
- Septoria pittospori
- Septoria planiuscula
- Septoria plantaginis
- Septoria plantaginis-majoris
- Septoria podolica
- Septoria polaris
- Septoria polemonii
- Septoria polygalicola
- Septoria polygonati
- Septoria polygonorum
- Septoria posoniensis
- Septoria primulae-latifoliae
- Septoria primulicola
- Septoria prismatocarpi
- Septoria prostrata
- Septoria protearum
- Septoria pteridicola
- Septoria pulmonariae
- Septoria putrida
- Septoria pyrenaica
- Septoria quercus
- Septoria rajkoffi
- Septoria ranojevicii var. allii-obliqui
- Septoria ranunculacearum
- Septoria ranunculi
- Septoria ranunculi-repentis
- Septoria recondita var. quercicola
- Septoria repanda
- Septoria rhamni
- Septoria rhamnigena
- Septoria rhea
- Septoria rhododendri
- Septoria rhodotypi
- Septoria rhoeadis
- Septoria rhoina
- Septoria rhois-verniciferae
- Septoria ribis
- Septoria rivini
- Septoria roemeriana
- Septoria rohlenae
- Septoria rorippae
- Septoria rosae
- Septoria rosae-sinensis
- Septoria rubiae-tinctorum
- Septoria rubicola
- Septoria rumicis
- Septoria rumicum
- Septoria sagittariae
- Septoria salicis
- Septoria salviae
- Septoria sambac
- Septoria sambucina
- Septoria saniculae
- Septoria sanzii
- Septoria saponariae
- Septoria saxifragae
- Septoria saxifragae-stellaris
- Septoria scabiosicola
- Septoria scabra
- Septoria schirajewskii
- Septoria scillae
- Septoria scopariae
- Septoria scutellariae
- Septoria secalis
- Septoria sedi
- Septoria sedicola
- Septoria seminalis
- Septoria senecionis
- Septoria serbica
- Septoria sibthorpiae
- Septoria sii
- Septoria silenes-nutantis
- Septoria sileris
- Septoria silybi
- Septoria sinapis
- Septoria sinapis-albae
- Septoria sisymbrii
- Septoria sleumeri
- Septoria smarodsii
- Septoria smilacis
- Septoria smyrnii
- Septoria sojina
- Septoria soldanellae
- Septoria sonchi
- Septoria sonchicola
- Septoria sonchifolia
- Septoria sorbi
- Septoria spartii
- Septoria spec.
- Septoria spinaciae
- Septoria stachydicola
- Septoria stachydis
- Septoria staphyleae
- Septoria staphysagriae
- Septoria stellariae
- Septoria stipata
- Septoria succisicola
- Septoria sylvicola
- Septoria symphyti
- Septoria syriacae
- Septoria syringae
- Septoria tami
- Septoria tanaceti
- Septoria taraxaci
- Septoria tau-saghyzi
- Septoria taurica
- Septoria tenella
- Septoria teucrii
- Septoria thelygoni
- Septoria tibia
- Septoria tiliae
- Septoria tinctoriae
- Septoria tomates
- Septoria torilicola
- Septoria tormentillae
- Septoria torminalis
- Septoria tozziae
- Septoria trapae-natantis
- Septoria tremulae
- Septoria trientalis
- Septoria tritici var. lolicola
- Septoria tritici-cristati
- Septoria turcica
- Septoria ulmariae
- Septoria umbrosa
- Septoria undulispora
- Septoria unedonis var. vellanensis
- Septoria urgineae
- Septoria urticae
- Septoria urticae var. parietariae
- Septoria vaccariae
- Septoria vaccinii-uliginosi
- Septoria valerianae
- Septoria vandasii
- Septoria variegata
- Septoria vassiljevskii
- Septoria ventenatae
- Septoria verbenae
- Septoria veronicae
- Septoria versicolor
- Septoria viburni
- Septoria viciicola
- Septoria viciosoana
- Septoria villarsiae
- Septoria vincae
- Septoria vincetoxici
- Septoria vindobonensis
- Septoria vinea
- Septoria violae-palustris
- Septoria virgaureae
- Septoria viscariae
- Septoria voglinoana
- Septoria wahlenbergiae
- Septoria weigeliae
- Septoria wilsonii
- Septoria wistariae
- Septoria wodziczkiana
- Septoria xanthifoliae
- Septoria xanthii
- Septoria xylostei
- Septoria zimmermanni-hugonis
- Septoria ziziphi
- Septoria zygophylli
- Sirosporium
- Sphaerella
- Sphaerella adoxae
- Sphaerella alba
- Sphaerella ariadna subsp. tormentillae
- Sphaerella belladonnae
- Sphaerella botrychii
- Sphaerella callistea
- Sphaerella capreolatae
- Sphaerella circe
- Sphaerella circumdans
- Sphaerella dejanira
- Sphaerella elatior
- Sphaerella erysiphoides
- Sphaerella ficus
- Sphaerella gibelliana
- Sphaerella guadarramica
- Sphaerella ilicis
- Sphaerella implexae
- Sphaerella laburni
- Sphaerella laureolae
- Sphaerella longissima
- Sphaerella maculans
- Sphaerella manginii
- Sphaerella paronychiae
- Sphaerella perimens
- Sphaerella polifoliae
- Sphaerella rhoina
- Sphaerella syringicola
- Sphaerella teucrii
- Sphaerella ulmifolia
- Sphaerulina
- Stigmina
- Zygoseptoria
- Zymoseptoria
- Schizothyriaceae
- Teratosphaeriaceae