- Gloniales
- Mytilinidiales
- Pleosporales
- Amniculicolaceae
- Amorosiaceae
- Anteagloniaceae
- Astrosphaeriellaceae
- Bambusicolaceae
- Caryosporaceae
- Coniothyriaceae
- Corynesporaceae
- Cryptocoryneaceae
- Cucurbitariaceae
- Cyclothyriellaceae
- Dacampiaceae
- Depressiostiolaceae
- Diademaceae
- Dictyosporiaceae
- Didymellaceae
- Allophoma
- Anthodidymella
- Ascochyta
- Boeremia
- Calophoma
- Darluca
- Didymella
- Didysimulans
- Ectodidymella
- Ectophoma
- Epicoccum
- Heterophoma
- Juxtiphoma
- Leptosphaerulina
- Longididymella
- Neoascochyta
- Neodidymelliopsis
- Neomicrosphaeropsis
- Neoscirrhia
- Nothophoma
- Paraboeremia
- Paramacroventuria
- Phaeomycocentrospora
- Phomatodes
- Platychora
- Sclerotiophoma
- Similiphoma
- Stagonosporopsis
- Vacuiphoma
- Xenodidymella
- Didymosphaeriaceae
- Dothidotthiaceae
- Fenestellaceae
- Fuscostagonosporaceae
- Halotthiaceae
- Lentitheciaceae
- Leptosphaeriaceae
- Lophiostomataceae
- Lophiotremataceae
- Macrodiplodiopsidaceae
- Massariaceae
- Massarinaceae
- Melanommataceae
- Microsphaeropidaceae
- Microsphaeropsidaceae
- Montagnulaceae
- Mycoporaceae
- Neohendersoniaceae
- Neopyrenochaetaceae
- Nigrogranaceae
- Ohleriaceae
- Paradictyoarthriniaceae
- Periconiaceae
- Phaeosphaeriaceae
- Acericola
- Ampelomyces
- Arezzomyces
- Bhatiellae
- Chaetosphaeronema
- Dematiopleospora
- Embarria
- Entodesmium
- Eudarluca
- Galiicola
- Hawksworthiana
- Hendersonia
- Italica
- Jeremyomyces
- Juncaceicola
- Longispora
- Monascostroma
- Muriphaeosphaeria
- Neodacampia
- Neosetophoma
- Neostagonospora
- Nodulosphaeria
- Ophiobolopsis
- Ophiobolus
- Ophiosimulans
- Ophiosphaerella
- Paraloratospora
- Paraophiobolus
- Paraphoma
- Parastagonospora
- Phaeodothis
- Phaeoseptoria
- Phaeosphaeria
- Phaeosphaeriopsis
- Piniphoma
- Populocrescentia
- Pseudoophiobolus
- Septoriella
- Setophaeosphaeria
- Setophoma
- Tiarospora
- Wojnowicia
- Wojnowiciella
- Phhaeosphaeriaceae
- Pleomassariaceae
- Pleosporaceae
- Pleosporales incertae sedis
- Pleosporineae
- Pseudodidymellaceae
- Pseudolophiotremataceae
- Pseudomassarinaceae
- Pseudopyrenochaetaceae
- Pyrenochaetopsidaceae
- Sporormiaceae
- Teichosporaceae
- Tetraplosphaeriaceae
- Thyridariaceae
- Torulaceae
- Zopfiaceae
- Venturiales